De eteriske oljene er flyktige, dvs de fordamper straks de kommer i kontakt med luft. Så nesten uansett hvilken metode som velges for bruk av de eteriske oljene, så vil noe bli inhalert og havne i lungene. Fordi den vanligste måten å bruke de eteriske oljene på er aromaterapi massasje, så er både huden og lungene de primære veiene som oljene kommer inn i kroppen og virker på.
I lungene
Når puster inn luft ved aromaterapi massasje, bad eller andre behandlinger puster vi også inn eterisk olje. Denne blandingen med luft og eterisk olje vandrer ned halsen og havner i bronkiene i lungene. Derfra blir oljene brakt over i blodet.
På huden
Ved kroppsmassasje blir kroppen dekket av en blanding med vegetabilsk baseolje iblandet en liten mengde eterisk olje. Huden er semi-permeabel, som betyr at den både kan avgi avfallstoffer, samtidig som den kan ta opp i seg stoffer med små molekylstrukturer som eteriske oljer. Fra huden blir de eteriske oljene brakt over i blodet.
I kroppen
Når de eteriske oljene først har kommet inn i kroppen og over i blodbanen blir de frakt rundt til de ulike organene og kroppssystemene. De fleste eteriske oljer har terapeutisk tilhørlighet til spesielle organer eller kroppssystemer. For eksempel rose eterisk olje har en rensende og regulerende effekt på livmoren. Når roseoljen er i kroppen føres den til livmoren og har en positiv effekt på denne.
I hjernen
Eteriske oljer har også en kraftig mental, emosjonell og psykologisk effekt. Hvis vi holder oss til rose eterisk olje så har denne også en anti-depressiv, beroligende og afrodisiaka effekt. Så en aromaterapeut ville antagelig inkludere rose eterisk olje i en massasjeblanding for en kvinne som har problemer med å bli gravid. Roseoljen ville ha en generell effekt på denne kvinnen både når det gjelder det fysiske, emosjonelle og psykologiske.